Magnesium is een van de meest onderbouwde supplementen voor de behandeling van migraine. 400–600 mg per dag van orale magnesium vermindert de frequentie en intensiteit van migraine in vergelijking met placebo in gerandomiseerde onderzoeken. Sommige studies vinden alleen voordeel aan de hogere kant (600 mg/dag), terwijl lagere doses (250–360 mg) vaak niet helpen. Voor acute aanvallen kan IV magnesium ook effectief zijn, vooral voor migraine met aura. Magnesium stabiliseert neuronale membranen (vermindert hersenhyperexcitabiliteit) en moduleert de cerebrale vasculaire tonus, twee kernprocessen in de biologie van migraine. Voor routinematige suppletie worden magnesiumglycinaat, -citraat of -tauraat geprefereerd vanwege de biologische beschikbaarheid. Magnesiumthreonaat krijgt aandacht voor de opname in de hersenen, maar het bevat zeer weinig elementair magnesium en zou niet de meer biologisch beschikbare vormen moeten vervangen wanneer je doel is om de totale magnesiumstatus te corrigeren. Een andere op bewijs gebaseerde regeling voor migrainepreventie is het combineren van magnesium met CoQ10 en riboflavine (B2), wat het aantal migraine dagen aanzienlijk verminderde in een proef van 3 maanden. Als maagklachten een probleem zijn, verdeel het totaal in ~200 mg doses die 1–3×/dag worden ingenomen. Dit houdt je in het bereik van 400–600 mg/dag dat effectief blijkt te zijn, terwijl het losse ontlasting vermindert.